Der in Basel gebürtige Raphael Clamer wollte ursprünglich Hubschrauberpilot werden. Während der Ausbildung entschied er sich jedoch für die Schauspielkunst und absolvierte seine Ausbildung an einer Schauspielakademie in München. Im Anschluss führten ihn Engagements an zahlreiche deutsche und schweizerische Bühnen. Mehrjährige Festengagements am Nationaltheater Mannheim sowie am Schauspielhaus Zürich bildeten wichtige Stationen seiner Laufbahn. Seitdem arbeitet er als freischaffender Schauspieler für Theater, Film und Fernsehen sowie als Sprecher für Hörspiele und Hörbücher. Er gastierte unter anderem am Burgtheater Wien, bei der Ruhrtriennale, an der Volksbühne Berlin, den Wiener Festwochen, am Théâtre Vidy-Lausanne, am Schauspielhaus Zürich sowie am Theater Basel, wo er regelmäßig als Gast engagiert ist. Seit nahezu drei Jahrzehnten verbindet ihn eine kontinuierliche Zusammenarbeit mit Christoph Marthaler. Gemeinsam entstanden zahlreiche Produktionen, darunter Platz Mangel, Das Theater mit dem Waldhaus, Tiefer Schweb, Bekannte Gefühle, gemischte Gesichter, Riesenbutzbach, Papperlapapp, ±0 - Ein subpolares Basislager, Das Weisse vom Ei, Isoldes Abendbrot, Dr. Watzenreuters Vermächtnis und Tiefer Graben 8. Ein weiterer Schwerpunkt seiner Arbeit liegt im Musiktheater. Er wirkte in zahlreichen Produktionen der Berliner Opernkompanie Novoflot mit und tritt regelmäßig als Sprecher und Sänger mit Orchestern auf. Mit Philippe Quesne arbeitete er in den Uraufführungen Farm Fatale und Cosmic Drama, das am Theater Basel uraufgeführt wurde und international auf Tournee ging. Darüber hinaus arbeitete Raphael Clamer unter anderem mit Johannes Schaaf, Luc Bondy, Sven-Eric Bechtolf, Herbert Fritsch, Jan Bosse, Andreas Kriegenburg, Isabel Osthues, Christiane Pohle, Stefan Pucher, Christina Rast und Marie Bues zusammen.